As Bibliotecas Sectoriais são pequenos núcleos organizados em cada um dos serviços da Faculdade de Medicina.

Cada uma destas Bibliotecas tem o seu núcleo próprio e dão apoio directo aos médicos e investigadores de cada um dos serviços a que pertencem. Abaixo, apenas são referidas as respectivas listagens de periódicos que cada uma das Bibliotecas possui.